В качестве основных источников финансирования деятельности ПРИОР рассматриваются:

• гранты фондов и других финансовых институтов, международных организаций и программ для поддержки некоммерческих, социально значимых проектов и программных мероприятий;
• средства федерального бюджета Российской Федерации в рамках целевых федеральных программ;
• средства региональных и муниципальных бюджетов субъектов Российской Федерации по каналу софинансирования партнерских проектов, поддерживаемых местными органами власти в качестве приоритетных для решения задач электронного развития;
• добровольные финансовые и имущественные взносы участников Партнерства и учредителей, участников Фонда ПРИОР;
• вклад партнеров в форме консультаций, готовых информационных ресурсов, вычислительной техники и программных средств, сетевых услуг, результатов исследований, организационной поддержки, площадей и иных ценностей, способствующих развитию ПРИОР;
• доходы от предпринимательской деятельности структурных подразделений ПРИОР - Дирекции, Фонда развития информационного общества, Информационно-аналитического центра, а также вновь создаваемых предприятий;
• венчурные инвестиции, предоставляемые инвестиционными компаниями и группами для реализации высокотехнологичных проектов с долгосрочной перспективой возврата вложенных средств;
• займы и кредиты, предоставляемые на льготных условиях финансовыми институтами на реализацию крупных проектов под гарантии Правительства Российской Федерации и субъектов федерации.

Основная часть средств будет централизованно аккумулироваться в Фонде развития информационного общества и распределяться по решению Координационного совета ПРИОР и Совета Фонда на основании рекомендаций Экспертного совета. Фонд, согласно законодательству Российской Федерации, обязан ежегодно публиковать отчеты о своей деятельности, включая направления расходования финансовых средств.